Problemas con la electroforesis en gel bidimensional
(1) Identificación de proteínas de baja copia. Las proteínas traza en el cuerpo humano suelen ser proteínas reguladoras importantes. Además de los métodos para aumentar la sensibilidad de la electroforesis en gel bidimensional, el método más prometedor es aplicar espectrometría de masas de ionización/desorción láser asistida por medio a membranas de PVDF, pero la tecnología actual no es suficiente para detectar proteínas con números de copias inferiores a 1.000. .
(2) Separación de proteínas extremadamente ácidas o extremadamente básicas.
(3) Extremadamente grande (gt; 200 kD) o extremadamente pequeña (lt; 10 kD = separación de proteínas).
(4) Detección de proteínas insolubles, que incluyen algunas proteínas de membrana importantes.
(5) Obtener electroforesis en gel bidimensional de alta calidad requiere una tecnología exquisita, por lo que se necesita con urgencia la aparición de equipos automáticos de electroforesis bidimensional.