Fundada por el entomólogo alemán W. Hennig en 1950, es una de las tres escuelas taxonómicas más populares en la actualidad. La taxonomía de clados rechaza el concepto de parentesco basado en la comparación de similitud general, argumentando que si dos taxones tienen un ancestro que no es compartido por un tercer taxón, entonces la relación entre los dos taxones es cercana a cualquiera de ellos. La relación entre un taxón y un tercer taxón. Según el concepto de parentesco basado en la similitud morfológica, la relación entre cocodrilos y lagartos es más cercana a la que existe entre cocodrilos y palomas domésticas o gorriones. Los dos primeros son reptiles y los dos últimos son aves. Si se tiene en cuenta la proximidad de sus ancestros comunes, queda claro que el ancestro común del cocodrilo y la paloma doméstica o el gorrión vivieron en una época similar al ancestro común del lagarto. Por lo tanto, los cocodrilos y los gorriones deben estar en la misma categoría, que puede incluir otras aves, pero no incluye reptiles como los lagartos. Estos dos métodos de clasificación y resultados completamente diferentes se pueden representar gráficamente.
El libro "Bases teóricas de la clasificación filogenética" se publicó en 1950. Sin embargo, debido a que el libro se publicó en alemán y sus puntos de vista contradecían la sistemática integral popular de la época, no recibió suficiente atención. No fue hasta la revisión del libro "Taxonomía sistemática" en 1966 que se publicó directamente en inglés en los Estados Unidos. Su influencia se expandió gradualmente y su alcance de aplicación se expandió desde los insectos a todo el reino animal. gran impacto en la sistemática biológica, pero también afectó a la geografía, la paleontología y otras materias. Ahora se ha convertido en una de las tres principales escuelas de taxonomía (taxonomía evolutiva, taxonomía numérica y taxonomía cladística).
, mientras que la teoría cladística está representada por la taxonomía cuantitativa de Sokal y Sneath (también conocida como sistemática fenotípica).