Ayuda a analizar una oración
En primer lugar, venir no es un verbo auxiliar, por lo que no puede aparecer al mismo tiempo que are.
En segundo lugar, si significa "¿Por qué volviste tan tarde?", debes usar por qué en lugar de cómo.
La afirmación correcta puede ser:
Por qué llegaste tan tarde a casa
Por qué llegaste tan tarde a casa
1. Si en circunstancias especiales, debe usar cómo. Simplemente use cómo en lugar de por qué. Pero si usas cómo... Sólo puedo imaginar una situación: padre e hijo salen de algún lugar para regresar a casa al mismo tiempo, o el padre llega temprano y sucede algo casi imposible. El hijo se sorprendió y le preguntó a su padre qué hacer. Pero en general por qué es más cómodo.
2. Es absolutamente redundante. Si no hay dudas, entonces esta oración debería ser sb. Está bien volver tarde a casa. Entonces ven es el único verbo en esta oración. Si usas una forma negativa o interrogativa, debes usar el verbo auxiliar do.