Cómo analizar los resultados de la secuenciación de genes

Puede secuenciar con un cebador desde el otro extremo y puede medir la secuencia desde el otro extremo de la secuencia hasta el final, de modo que obtenga el complemento inverso de su cebador al final de la secuencia.

Si desea utilizar sus datos existentes para encontrar genes/vías/redes relacionadas con enfermedades, entonces salga y diríjase directamente al análisis de expresión diferencial.

Primero observe el diagrama de picos de secuenciación. Si el mapa de colores del resultado muestra un tipo de pico único y nítido que es consistente con el código correspondiente a la base, se puede juzgar que se puede usar la secuencia. Si se producen fenómenos anormales como picos dobles o interrupción de la señal, es necesario prepararlo nuevamente o clonarlo antes de la secuenciación.

Por lo general, el pliegue del gen diana en relación con el gen estándar se puede determinar mediante PCR cuantitativa de fluorescencia, y el número del gen diana se puede conocer seleccionando un punto de referencia determinado. Sin embargo, a veces, debido a la pequeña cantidad de muestras de ADN, se utilizan métodos de secuenciación de alto rendimiento de segunda generación para detectar pliegues cromosómicos.

Una vez secuenciada la secuencia del gen, generalmente es necesario comparar la secuencia para ver la diferencia entre ella y la secuencia objetivo. El software más utilizado es DNAman y vectorVI de Invitrogen también es bueno. Además, también puede comparar directamente en línea. Se recomienda que la voladura del sitio web del NCBI se pueda realizar directamente en línea.

Clonado en vector plasmídico y secuenciación centralizada [9, 10]. El resultado final de sAGE se obtiene mediante estadísticas informáticas, y la abundancia de expresión genética se juzga y calcula en función de la frecuencia de aparición de una etiqueta.