¿Qué SCI aceptan la clasificación de familias de genes y el análisis estructural?

OsMKK es una familia de genes de mitógeno quinasa ubicada en el tramo medio de la vía MAPK del arroz. Es el principal responsable de las funciones de convergencia de señales ascendentes y difusión gradual descendente. y transmisión. Sus funciones en el crecimiento, el desarrollo y la respuesta al estrés del arroz no están claras. El estrés abiótico, como la sequía, las bajas temperaturas y el daño causado por la sal, son factores importantes que afectan el rendimiento del arroz. Este artículo utiliza la bioinformática para analizar la estructura de la familia de genes OsMKK y predecir sus posibles funciones biológicas. Utilizando la variedad de arroz índica 9311 como material, las plántulas de arroz se sometieron a estrés de baja temperatura, alta temperatura, daño por sal, H2O2, ABA, JA y SA. Se midieron los cambios en los indicadores fisiológicos de las plántulas de arroz y los patrones de expresión de la familia de genes OsMKK en siete tratamientos. Finalmente, se discuten sus posibles funciones biológicas. Los principales resultados son los siguientes: ubicación de los cromosomas, árbol filogenético y análisis de la estructura genética de 1. La investigación de OsMKK muestra que los ocho miembros de la familia de genes OsMKK están ubicados en cuatro cromosomas diferentes y se dividen en cuatro subcategorías: A, B, C y d. La primera categoría tiene tres genes: OsMKK1, OsMKK6 y OsMKK3. intrones y exones, con diversas formas regulatorias. La segunda categoría incluye cinco genes: OsMKK4, OsMKK5, OsMKK10-1, OsMKK10-2 y OsMKK10-3, que contienen solo un exón. El análisis de subdominios y motivos de OsMKK mostró que esta familia de genes contiene 11 subdominios, sitios de unión de ATP y sitios de fosforilación. Excepto OsMKK10-1, osmkk10-2 y OsMKK10-3, todos contienen el motivo S/T XXXXX S/T. 2. El elemento que actúa en cis en el promotor de la región ATG terminal 5' de la familia de genes osmkk. Como elemento de respuesta a baja temperatura, elemento de respuesta al choque térmico, elemento de respuesta a la deshidratación, elemento de respuesta ABA, elemento de respuesta JA y elemento de respuesta de defensa. Cada gen contiene muchos elementos diferentes que actúan en cis y que pueden estar implicados en muchos efectos adversos. Los cambios en los indicadores fisiológicos de las etapas de las plántulas de arroz bajo los tratamientos 3.7 mostraron que los cambios en la conductividad relativa, el contenido de malondialdehído y prolina fueron consistentes. Con la prolongación del tiempo de estrés, la conductividad relativa aumentó (excepto para el tratamiento con ABA); el contenido de malondialdehído aumentó en diversos grados y el contenido de prolina también mostró una tendencia ascendente (excepto para el tratamiento con JA). Los resultados mostraron que a medida que se prolongaba el tiempo de estrés, las células de las plántulas de arroz sufrían cada vez más daños. La expresión de 4.4. La familia de genes OsMKK tiene propiedades de inducción obvias bajo tensiones de 12 °C de baja temperatura, 38 °C de alta temperatura, sal 250 mM, 10 mMH2O2, ABA 50 μM, JA 50 μM y SA 1 mM. A la baja temperatura de 12 °C, la expresión de OsMKK4 no cambió de 0 a 12 h, pero se indujo a las 24 h a 38 °C, la expresión de OsMKK3 se activó a las 3 h y luego disminuyó; La expresión de OsMKK4, OsMKK5 y OsMKK6 fue más fuerte a las 6 h y luego disminuyó. La expresión de otros genes aumentó ligeramente a las 6 h; bajo tratamiento con sal 250 mM, la expresión de OsMKK3 se indujo a la 1 h y alcanzó el nivel más alto. Bajo el tratamiento de H2O2 10 mM, la expresión de OsMKK4, OsMKK5 y OsMKK10-2 se indujo transitoriamente en 1 h, y la expresión alcanzó el nivel más alto y luego disminuyó. Bajo el tratamiento con ABA 50 μM, la expresión de OsMKK4 y OsMKK5 se indujo a 1 h; bajo el tratamiento con JA 50 μM, la expresión inducida de OsMKK4 fue la más fuerte y aumentó con el tiempo. Seguido de OsMKK5, la expresión aumentó instantáneamente a la hora y luego dejó de aumentar con el tratamiento con 1 mMSA, la expresión de OsMKK6 se indujo en 6 horas y la expresión alcanzó el nivel más alto. Diversas adversidades tienen poco efecto sobre la expresión de otros genes. 5.5 expresión. OsMKK se diferencia en los tallos, hojas, vainas de las hojas y panículas jóvenes del arroz. La expresión de OsMKK1 fue baja en los tallos y otros genes se expresaron en los cuatro tejidos. El nivel de expresión de OsMKK10-2 no fue alto en los cuatro tejidos y los niveles de expresión de otros genes fueron altos o bajos en los cuatro tejidos.