Comparación de la diversidad de la flora intestinal principal en varios animales de experimentación y humanos de uso común
Los seres humanos son un "superorganismo" compuesto por un 10% de células humanas y un 90% de células microbianas. En el intestino humano viven alrededor de 1014 y más de 1000 tipos de microorganismos. Es la comunidad biológica más grande y compleja en humanos y animales. Se divide principalmente en bacterias fisiológicas (Bacteroidetes, Bifidobacterias, Bacteroidetes, etc.) que coexisten. con el anfitrión. Los patógenos oportunistas (Enterobacteriaceae, Enterococcus, etc.) y la mayoría de los patógenos (Proteus, Vibrio cholerae, Shigella Dysenteriae, etc.) se distribuyen principalmente en el colon. En circunstancias normales, la flora intestinal mantiene una relación biológica y antagónica independiente, afectando a la salud de humanos y animales en muchos aspectos como la digestión, la absorción de nutrientes, el aporte energético, el metabolismo de las grasas, la regulación inmune, el metabolismo de los fármacos, la toxicidad, etc. Para el estudio de la microecología intestinal, el método tradicional consiste en obtener cierta información mediante cultivo selectivo de microorganismos o observación morfológica directa, para luego identificarlos y clasificarlos. Las limitaciones de los métodos de cultivo tradicionales son que el proceso de cultivo requiere mucho tiempo y mano de obra, se ve afectado fácilmente por los métodos operativos y tiene baja sensibilidad. Es difícil o imposible aislar y cultivar la mayoría de los microorganismos con la tecnología de cultivo existente; detectar cualitativamente bacterias cultivables, pero no puede identificar bacterias desconocidas. Las bacterias no pueden reflejar con precisión la cantidad y diversidad de las comunidades microbianas intestinales, lo que hace imposible que los humanos comprendan completamente la relación entre los microorganismos intestinales y sus huéspedes, y dificulta la comprensión humana de los microorganismos intestinales.