Características de las etiquetas SSR
Se descubrió que el número de unidades repetidas en los microsatélites era muy variable, lo que se manifiesta como una variación aneuploide en el número de microsatélites o las secuencias de las unidades repetidas pueden no ser idénticas, lo que resulta en polimorfismo en múltiples loci. Si se pueden revelar estas mutaciones, podremos descubrir polimorfismos en diferentes SSR en diferentes especies e incluso en diferentes individuos. Sobre la base de esta idea, se desarrollaron etiquetas SSR. Los marcadores SSR, también conocidos como sitios de microsatélites de etiquetas de secuencia, abreviados como STMS, son actualmente uno de los marcadores de microsatélites más utilizados. Dado que la secuencia flanqueante de un microsatélite específico en el genoma suele ser una secuencia única altamente conservada, los fragmentos de ADN que flanquean el microsatélite se pueden clonar y secuenciar, y luego se puede realizar la amplificación por PCR utilizando cebadores sintetizados artificialmente basados en la secuencia flanqueante del microsatélite. Agregue un único lugar de microsatélite. Debido a la variación en el número de unidades repetidas en un solo locus de microsatélites, la variación en la longitud de los productos de amplificación individuales conduce a un polimorfismo de longitud, llamado polimorfismo de longitud de repetición de secuencia simple (SSLP). Cada locus A amplificado representa un par de alelos para ese locus. . Debido a que el número de repeticiones SSR varía mucho, los marcadores SSR pueden revelar polimorfismos mucho mayores que los RFLP. Este es el principio de los marcadores SSR.
En comparación con otros marcadores moleculares, los marcadores SSR tienen las siguientes ventajas: (1) son abundantes, cubren todo el genoma y revelan un alto grado de polimorfismo (2) tienen las características de múltiples alelos; y proporcionan una gran cantidad de información. Grande (3) Se hereda de manera mendeliana, mostrando * * * dominancia (4) Cada locus está determinado por la secuencia de cebadores diseñada, lo que facilita la comunicación y la cooperación entre diferentes laboratorios para desarrollar cebadores.