El papel del SDS en la electroforesis en gel de poliacrilamida con SDS
Desnaturalización y disociación de proteínas, determinación de la masa molecular relativa de las proteínas, etc.
1. El SDS puede interactuar con las proteínas para desnaturalizarlas y disociarlas en subunidades individuales. SDS despliega la proteína en una estructura lineal al interactuar con regiones hidrófobas de la proteína y le da a la proteína una carga negativa. Dado que la cadena hidrofóbica de SDS interactúa más fuertemente con la región hidrofóbica de la proteína, SDS cubrirá la superficie de la proteína, dándole a la proteína una carga negativa. De esta forma, las proteínas se moverán en el gel según su peso molecular en el campo eléctrico, consiguiendo así la separación de proteínas.
2. Dado que la proporción de masa de SDS a proteína es fija, es decir, cada molécula de SDS se une a aproximadamente 2,7 residuos de aminoácidos, se puede utilizar SDS-PAGE para determinar la distancia de migración de la proteína. en el gel, infiera la masa molecular relativa de la proteína. Dado que el SDS produce proteínas cargadas negativamente, la velocidad de migración de las proteínas en un campo eléctrico es inversamente proporcional a su masa molecular relativa. Por lo tanto, las proteínas con pesos moleculares mayores migrarán más lentamente y las proteínas con pesos moleculares más pequeños migrarán más rápido.