Secuencia del gen de la caja Y
Secuencia de ADN de la caja Y (CTGATTGGCCAA) en la región promotora del gen. ¿Cuál es la secuencia de aminoácidos de la proteína de unión a la caja Y?
Características típicas. En el extremo amino hay un dominio altamente conservado que consta de 80 residuos de aminoácidos. Este dominio tiene una alta homología con la proteína de choque frío CS 7.4 en E. coli, por lo que se denomina dominio de choque frío (Cold
dominio de choque, CSD). El análisis de mutación genética confirmó que CSD es un dominio que se une al ADN y al ARNm.
En la CSD existe un dominio similar a RNP-1 que es rico en aminoácidos aromáticos y arginina. CSD no contiene ningún dominio de unión al ADN conocido, como dedos de zinc, hélices α de ángulo helicoidal, cremalleras de leucina, etc. CSD consta de 5 elementos inversos.
Hebras de láminas β paralelas conectadas mediante ángulos y bucles. Desde el CSD hasta el extremo C hay un dominio hidrófilo.
Actualmente se sabe que el dominio hidrófilo C-terminal participa principalmente en la agregación propia o heteróloga entre proteínas de unión a la caja Y.
La proteína de unión a la caja Y es una molécula altamente conservada en la evolución que no sólo participa en la regulación del nivel de transcripción, sino que también
está relacionada con la regulación del nivel de traducción. y también puede estar involucrado en la regulación intracelular. Están involucrados muchos eventos importantes, como el transporte de ARN y la localización intracelular.
Las proteínas de unión a la caja Y no solo pueden unirse a los promotores que contienen la caja Y, sino que también sirven como factores reguladores para participar en la regulación transcripcional celular.
Se une al ARNm, oculta el ARNm e inhibe la traducción. Su papel como acompañante molecular permite que las macromoléculas del cuerpo permanezcan activas a bajas temperaturas, ayudando así a las células a resistir la prueba de las bajas temperaturas.