Tutorial sobre cómo dibujar la curva ROC usando Graphpad

En el análisis de modelos de biomarcadores, existe otro método de análisis comúnmente utilizado: el análisis de curvas ROC. Como se muestra en la figura siguiente, la curva ROC también es un gráfico de análisis común en este tipo de literatura. Combinados con datos clínicos, los genes o modelos pueden validarse como marcadores para el diagnóstico y pronóstico de enfermedades.

Entonces, ¿cómo dibujar la curva ROC con Graphpad? La siguiente figura se utiliza como ejemplo para demostrar paso a paso.

1? Preparación de datos

Para dibujar la curva ROC se requiere el estado de supervivencia y la expresión genética, y los datos se organizan en tablas. Archivos de muestra datos de muestra. xlsx.

(1) Paciente: número de paciente; (2) Estado: estado de supervivencia, donde 0 significa supervivencia y 1 significa muerte; (3) Expresión: expresión genética (o puntuación de riesgo del modelo).

2? Usar Graphpad para el análisis ROC

A continuación, abra Graphpad, seleccione Columna y haga clic en Crear.

Copia los datos de ROC en Excel a Graphpad.

Haga clic en Analizar en Análisis, seleccione Curva ROC en Análisis de columnas y haga clic en Aceptar.

Seleccione la línea de identidad (si dibujar una línea de referencia o no, AUC=0,5) en el parámetro: Curva ROC y haga clic en Aceptar.

Haga clic en el área en la ROC del dato 1 en los resultados. El área bajo la curva ROC es el valor AUC que necesitamos.

3? Dibujar la curva ROC

Haga clic en la curva ROC: ROC del dato 1 en el gráfico.

Haga doble clic en el eje de coordenadas para modificar los parámetros relacionados. Haga clic en el marco y el origen, seleccione el tamaño del cuadrado y modifique el ancho y el alto. Seleccione Marco normal en Estilo de marco.

Haga clic en el eje X para deseleccionar Determinar rangos e intervalos automáticamente. Modifique el valor mínimo (valor mínimo del eje x), el valor máximo (valor máximo del eje x) y los intervalos de tick principales. Haga clic en el eje izquierdo para modificar los mismos parámetros.

Haga doble clic en el área de dibujo, seleccione la ROC de Datos1: Curva ROC: sensibilidad en el conjunto de datos, anule la selección de parámetros como símbolos de visualización (mostrar puntos clave), color, estilo (cambie el tipo a polilínea ), mostrar leyenda, etc.; Modificar el conjunto de datos a la ROC de Datos1: Curva ROC: Indentidad y modificar los mismos parámetros.

Modifique los títulos de los ejes X e Y, ajuste la leyenda a la posición adecuada y se dibujará el gráfico ROC.

El resultado sigue teniendo buena pinta, ¿verdad?