¿Cuál es la diferencia entre estar en un automóvil y viajar en un automóvil?
En el coche significa: en el coche
En coche significa: de paseo
La única diferencia entre ambos es que uno está dentro del coche y el otro fuera del coche.
Voy a la escuela en el auto de mi padre
Traducción; Voy a la escuela en el auto de mi padre.
Voy al colegio en coche
Traducción; Voy al colegio en coche.
En cuanto a cuándo usarlo, depende del significado de la pregunta. No te preocupes, el significado de la pregunta quedará claro.