La Red de Conocimientos Pedagógicos - Conocimientos universitarios - ¿Qué tan difícil será publicar un artículo reescrito en 2020? ¡Explícalo claramente en un artículo!

¿Qué tan difícil será publicar un artículo reescrito en 2020? ¡Explícalo claramente en un artículo!

El transcriptoma es un proyecto de amor-odio. El umbral experimental es bajo, pero es el área más afectada por la proliferación de artículos. La gente siempre me pregunta: ¿el transcriptoma todavía puede publicar artículos? Permítanme tomar como ejemplo un artículo publicado en BMC Genomics el 4 de mayo de 2020. El título es: El análisis del transcriptoma devuelve una responsabilidad de defensa rápida donde induce la alimentación fitotóxica del pulgón del trigo. Discuta en detalle las transcripciones publicadas en 2020. Qué difícil es redactar. un articulo? ¿Cómo enviarlo? Echemos un vistazo al contenido específico de este artículo: Introducción al experimento: este artículo estudia la rápida respuesta de defensa de las plántulas de trigo después de ser devoradas por los pulgones del trigo. Después de 2, 6, 12, 24 y 48 h de alimentación, se tomaron hojas de plántulas (tres réplicas biológicas) para secuenciación del transcriptoma, determinación de clorofila, determinación de acumulación de H2O2 y tratamiento con inhibidor de NADPH para explorar más a fondo el mecanismo de defensa de la producción de oxígeno posterior a la picadura del trigo. . Resultados experimentales:

1.? Esta parte de los resultados del análisis del transcriptoma después de la alimentación del pulgón del trigo muestra una rutina comparativa, principalmente mediante el análisis de PCA para ver la correlación de la muestra y el efecto del tratamiento, e introduce la situación general de los genes diferenciales. Como se muestra en la siguiente figura:

2. Análisis diferencial de genes GO. El autor anotó GO según los conjuntos de genes regulados hacia arriba y hacia abajo, y discutió el enriquecimiento de los conjuntos de genes regulados hacia arriba y hacia abajo. según puntos de tiempo, como se muestra en la siguiente figura:

3.? Cambios en el contenido de clorofila de las hojas de trigo después de que el pulgón se alimenta. A partir del análisis diferencial del gen GO, se puede ver que la alimentación del pulgón tiene un efecto regulador negativo sobre el proceso fotosintético, la recolección de luz y los genes del trigo relacionados con el sistema fotosintético. Por lo tanto, el autor midió Los cambios en el contenido de clorofila de las hojas de trigo después de la alimentación se muestran en la siguiente figura:

4.? Expresión genética de las vías de defensa relacionadas con el ácido salicílico y el ácido jasmónico en las hojas de trigo después de la alimentación de los pulgones del trigo: el gen de la fenilalanina amoniaco liasa (PAL) implicado en la biosíntesis de SA se reguló significativamente en diferentes momentos, pero con el tiempo de alimentación. el nivel de expresión disminuyó gradualmente; los tres genes de la lipoxigenasa (LOX) en la vía del metabolismo del ácido jasmónico estaban regulados significativamente. Los factores de transcripción WRKY regulados por MAPK también muestran una regulación positiva, como se muestra en la siguiente figura:

5.? Cambios en la acumulación de peróxido de hidrógeno y la actividad de las enzimas antioxidantes en las hojas de trigo después de la alimentación de los pulgones: la alimentación de los pulgones aumentó significativamente la expresión de los genes captadores de especies reactivas de oxígeno; además, las hojas de trigo se tiñeron con 3,3'-diaminobencidina (DAB) para las células; Tinción, la acumulación de H2O2 ocurrió 2 horas después de la alimentación, y el número y tamaño de las manchas aumentaron gradualmente con la extensión del tiempo de alimentación, como se muestra en la siguiente figura:

6. y respuesta de defensa en hojas de trigo Influencia. DPI es un inhibidor de la NADPH oxidasa que no sólo inhibe significativamente la producción de oxígeno causada por la ingesta de alimentos, sino que también regula significativamente a la baja los niveles de expresión de los genes de respuesta de defensa en las hojas de trigo.

Lo anterior son todos los resultados de este artículo. Mirando hacia atrás, el diseño experimental no fue complicado y no había mucho contenido. ¿Por qué otros pueden publicar pero tú eres rechazado? Ya sabes, BMC Genomics tiene un factor de impacto de 3,5 en ambos campos, que es algo que mucha gente anhela pero no puede conseguir.

¿Qué tan difícil será publicar artículos de transcriptoma en 2020? De este artículo podemos ver que no es tan difícil como cree. Intento extraer los siguientes puntos, esperando que pueda ser de alguna utilidad para usted.

1. El diseño experimental es relativamente razonable y progresivo. Los puntos de muestreo corresponden básicamente a la reacción en cascada de tres niveles de la defensa de la planta. El análisis y la discusión posteriores están claramente organizados.

2. El transcriptoma es sólo una parte del experimento, y la era de enumerar los resultados de forma convencional ha terminado. Como en este artículo, además del transcriptoma, los autores midieron además indicadores fisiológicos como el contenido de clorofila, la producción de oxígeno y los rasgos relacionados con los genes para que los resultados sean más convincentes.

3. La introducción de datos del transcriptoma no debe ser vaga, debe combinarse con otros indicadores fisiológicos y bioquímicos para extraer y mostrar algunos genes relacionados, como la captura de luz, la luz y los genes relacionados con la acción que reducen. contenido de clorofila en este artículo; acumulación y resistencia de H2O2. Cambios en la actividad oxidasa.

4. La esencia del artículo reside en la parte de discusión. Puede citar datos de otras personas para probar sus resultados y puede citarlos ampliamente. ¡Los trabajos generalmente no salen mal! Para leer el texto original atentamente, haga clic en "Leer el texto original" al final del texto.

¿Qué tan difícil será publicar artículos de transcriptoma en 2020? De hecho, lo difícil es que no estás dispuesto a cambiar de opinión. Los tiempos han cambiado y la vieja rutina está obsoleta.

El problema al que se enfrentan muchos profesores ahora no es que no tengan datos o que no puedan escribir artículos, sino que no pueden comprender los datos y no pueden empezar a analizarlos. ¿Cómo pueden publicar un artículo si esta broma no cesa? ! Recomiendo a todos un video tutorial "Interpretación de los resultados del análisis del transcriptoma", que puede resolver fácilmente el problema de que no pueda comprender los datos de los resultados del transcriptoma.

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